Дата образования – 1923 год.
      Краткая история образования отдела
      Работы с плодовыми культурами в Никитском саду были начаты Х.Х. Стевеном. В 1912 г. был заложен фруктовый сад, в питомниках высажено 74 вида преимущественно плодовых деревьев и ягодных кустарников. В 1815 г. сортимент выращиваемого материала содержал около 770 наименований.
      К 1825 г. была собрана одна из самых богатых в Европе коллекций плодовых пород, содержащая более 300 сортов яблони, 295-груши, 80-черешни и вишни, более 70-сливы, 15-абрикоса, 20- персика и инжира, 200 сортов винограда. Занимались и интродукцией субтропических растений – маслины, цитрусовых. Саженцы лучших форм маслины распространились за пределы Крыма - на Кавказ, в Среднюю Азию, в Италию, Испанию, Францию. Дальнейшее интенсивное развитие этих работ принадлежит Н.А. Гартвису, под руководством которого значительно возрос генофонд. При Н.А. Гартвисе основное внимание было сосредоточено на дальнейшем обогащении и размножении плодовых пород. Это видно из предложенного им в 1873 г. каталога имевшихся в то время форм и сортов груши – 374, яблони – 369, сливы-64, черешни-72, вишни-37, персика-80, абрикоса-22, миндаля-4, инжира-34, граната-5, айвы-8, ореха-фундука-5, волошского ореха-4, всего 1078 наименований.
      В советский период деятельности Никитского сада значительную роль сыграли исследования И.Н. Рябова и К.Ф. Костиной. В 1923 г. был организован отдел южного плодоводства, которым до 1978 г. руководил профессор И.Н. Рябов. В это время расширяются работы по плодоводству, и начинается создание нового универсального сортимента пригодного и для консервной переработки. В поисках исходного материала организуется экспедиция в Среднюю Азию, различные районы Кавказа, где были найдены ценные формы персика, абрикоса, алычи, миндаля, инжира. В этот период в селекции начинает применяться метод отдаленных (межвидовых, межродовых) скрещиваний.
      В 1937 г. из состава отдела в самостоятельную единицу выделяется отдел субтропических плодовых культур, который возглавлял до 1978 г. профессор А.А. Рихтер.
      Интенсивно развертывались работы по интродукции и селекции плодовых культур. Новые сорта отличались повышенной зимостойкостью, широким диапазоном использования и высоким качеством плодов, что позволило продвинуть садоводство в более суровые условия степной зоны, поднять продуктивность садов, улучшить качество продукции. В 1962 г. к 150-летию со дня основания НБС, коллекция плодовых субтропических и орехоплодных культур содержала более 1800 сортов и форм.
      С 1978 г. исследования по плодоводству возглавил доктор с-х. наук, проф., В.К. Смыков, развернувший комплексную работу со всеми научными подразделениями Никитского сада.

      В Степное отделение из Молдавии был перебазирован большой генофонд всех плодовых культур. Такое объединение сил, направленное на решение главных вопросов развития промышленного садоводства, дало еще более значительные результаты. К своему 185-летию Никитский ботанический сад стал обладателем 97 видов и почти 5000 сортов и форм плодовых растений, размещенных как в Центре НБС, так и его Степном отделении. На этой базе развернулись обширные селекционные работы. Вновь созданный сортимент стал доминировать в промышленных садах персика, абрикоса, алычи, сливы.
      С 1994 г. по настоящее время отдел возглавляет кандидат с.-х. наук. А.В. Смыков. В 1997 г. отдел субтропических и орехоплодных культур, руководимый с 1978 г. по 1997 г. кандидатом биологических наук А.А. Ядровым вновь стал частью отдела южного плодоводства.
      Общий генофонд достиг более 8674 сортов и форм. В 2004 г. в состав отдела вошли плодоводы Помологической станции, и общий генофонд составил 11765 сортов и форм.

      Основные направления деятельности отдела:
      1. Интродукция.
      2. Селекция (с привлечением традиционных и новых методов: отдаленная гибридизация, биотехнология, мутагенез и т.д.).
      3. Сортоизучение (комплексное изучение с привлечением широкого круга имеющихся в НБС специалистов: физиологов, агроэкологов, биохимиков, климатологов, эмбриологов, биотехнологов, специалистов по защите растений).
      4. Производственное испытание новых сортов, технологий и новых видов переработки плодов.
      5. Руководство отдела: Смыков Анатолий Владимирович, кандидат сельхоз-наук.
      6. Персонал отдела: 32 сотрудника в Степном отделении, на Помологической станции и в Центре, в т.ч. 11 кандидатов наук, 2 доктора.
      7. Основные научные разработки отдела, в том числе те – которые могут иметь коммерческую ценность. Сорта, включенные в Реестр сортов Украины 1991-2004 гг.
      1. Персик - 7
      2. Инжир - 1
      3. Нектарин - 3
      4. Гранат - 1
      5. Абрикос - 6
      6. Хурма - 1
      7. Алыча - 2
      8. Зизифус - 2
      9. Яблоня - 3
      10. Маслина - 1
      11. Лимон - 1
      12. Слива - 2
      13. Миндаль - 3
      14. Черешня - 4
      15. Киви - 2
      16. Айва - 2

      Переданы в ГСИ (1991-2004 гг.):
      1. Персик - 18
      2. Яблоня - 3
      3. Нектарин - 11
      4. Груша - 3
      5. Абрикос - 3
      6. Хурма - 1
      7. Алыча - 4
      8. Зизифус - 3
      9. Слива - 1
      10. Миндаль - 4
      11. Черешня - 1
      12. Лимон - 2